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A cirurgia endoscópica tem como principal ferramenta o endoscópio, que é utilizado normalmente para cirurgia de hidrocefalia, tumores intraventriculares, tumores cerebrais, tumores de hipófise, tumores da base do crânio, tumores da órbita, cistos cerebrais, cirurgias da coluna, neurocisticercose e entre outras.
Na maior parte dos casos, o paciente é internado e passa por uma anestesia geral antes da cirurgia ocorrer. Como ela é pouco invasiva, o paciente pode deixar o hospital no mesmo dia ou alguns dias depois. O procedimento consiste em o médico fazer um pequeno corte na região examinada.
A cirurgia robótica é uma operação assista em que o médico faz a operação em conjunto com máquinas e robôs. É uma técnica pouco invasiva, em que todas os movimentos são conduzidos pelo cirurgião e executados através do robô, com controle de movimentos feito pelos joysticks na operação em questão.